原住民保留地的主管機關：

在中央是內政部。

在省（市）是省（市）政府。

在縣（市）是縣（市）政府。

原住民保留地有關農業事業，是由行政院農業委員會會同中央的主管機關辦理。

原住民保留地的管理機關：行政院原住民族委員會。

原住民保留地的執行機關是鄉（鎮、市、區）公所。